蒜苗含有辣素，杀菌能力能达到青霉素的1/10，对病原菌与寄生虫都有良好的杀灭作用，有预防流感、防止伤口感染、治疗感染性疾病与驱虫的功效。蒜苗的辣味主要是来自它的辣素，这种辣素具有消除积食的作用。

从某些方面来看，蒜苗的营养价值比大蒜高。它的膳食纤维、维生素C、维生素A、胡萝卜素等营养素的含量都要高于大蒜。同时，蒜苗中也含有大蒜素，所以它和大蒜有相似的保健功能。

蒜苗富含铜，铜是人体健康不可缺少的微量营养素，对于血液、中枢神经和免疫系统，头发、皮肤和骨骼组织以及脑子和肝、心等内脏的发育和功能有重要影响。