中医认为，黄花菜性味甘、凉、平。据分析，黄花菜中含有蛋白质、脂肪、糖、胡萝卜素、硫胺素、核黄素、尼克酸、维生素Ｃ、钙、磷、铁、钾、钠、镁等。药理研究表明，黄花菜可以清热凉血，利尿生津，平肝明目，养血催乳，安神除烦，解毒消痈。适用于血热出血，小便涩痛，心烦不安，肝虚有热，视物不清，水道不利，乳汁不下，疮痈肿毒等症。

黄花菜的花有健胃、通乳、补血的功效，哺乳期妇女乳汁分泌不足者食用，有通乳下奶的作用；根有利尿、消肿的功效，可用于治疗浮肿，小便不利；叶有安神的作用，能治疗神经衰弱，心烦不眠，体虚浮肿等症。各种萱草的根入药不分，而作为食用只用黄花萱草的花蕾。