低镁血症病因分类有以下几种：

肠吸收障碍

严重腹泻吸收不良综合征、溃疡性结肠炎、肠道大部分切除术肝硬化、胆道疾病、Crohn病等。

醛固酮分泌增多

醛固酮分泌增多

心力衰竭患者由于钠水储留常伴有继发性醛固酮分泌增多，醛固酮分泌增多使肠道镁吸收和肾小管镁重吸收减少。原发性醛固酮增多症表现有低镁血症。

肾脏疾病

如慢性肾盂肾炎、肾小管酸中毒的部分病例伴有肾小管重吸收机能减退，

醛固酮分泌增多

以及急性肾功能不全多尿期。

甲状腺功能亢进及甲状旁腺功能亢进患者约半数以上可表现低镁血症。

糖尿病酸中毒

由于尿镁显著增加可引起低镁血症胰岛素治疗后，镁向细胞内转移，可加重低血镁。

一些药物的应用

如长期应用利尿剂、庆大霉素、免疫抑制剂，使肾排镁增加。