引起自闭症的原因，有充分证据显示，自闭症学生与家庭背景和父母教养的态度无关，亦不是因后天环境造成自闭症，可能是由生理因素形成，如神经机能发展，生化机能发展，遗传因素或脑部受损所致。引起自闭症的原因，可能导致自闭症的成因包括：

遗传

引起自闭症的原因，从家族和挛生子的研究中，发现自闭症人士的挛生兄弟姊妹大约有10%至20%可能有轻微的自闭倾向。

受疾病感染

引起自闭症的原因，妇女怀孕期间可能因德国麻疹或风疹，使胎儿的脑部发育受损而导致自闭症。此外新陈代谢疾病亦会造成脑细胞功能失调，影响脑神经传递信息的功能，因而造成自闭症。还有，在怀孕期间窘迫性流产等因素而造成婴儿大脑发育不全，早产，难产，新生儿脑部受伤，以及在婴儿期患上脑炎，脑膜炎等疾病造成脑部伤害，都可能会增加罹患自闭症的机会。