第一：免疫组织学检查。

常用过氧化物酶抗过氧化物酶方法显示湿疣内的病毒蛋白，以证明疣损害中有病毒抗原。HPV蛋白阳性时尖锐湿疣的浅表上皮细胞内可出现淡红色的弱阳性反应。

第二：醋酸白试验。

蛋白质与酸凝固变白的结果HPV感染细胞产生的角蛋白与正常的未感染上皮细胞产生的不同，只有前者才能被醋酸脱色。醋酸白试验检测HPV的敏感性很高它比常规检测观察组织学变化还好。醋酸白试验并不是特异试验，且假阳性较常见。

第三：组织化学检查。

取少量病损组织制成涂片用特异抗人类乳头瘤病毒的抗体作染色。如病损中有病毒抗原，则抗原抗体结合在过氧化物酶抗过氧化物酶方法中，核可被染成红色。此法特异性强且较迅速对诊断有帮助。

第四：病理检查。

因为角化不全棘层高度肥厚，乳头瘤样增生，表皮突增厚延长，其增生程度可似假性上皮瘤样。刺细胞和基底细胞并有相当数量的核分裂颇似癌变。但细胞排列规则，且增生上皮和真皮之间界限清楚其特点为粒层和刺层上部细胞有明显的空泡形成。