女性尖锐湿疣的治疗难度很大，患者若不及时进行专业的治疗，疾病就很容易反复发作。而目前常见的治疗方法有以下几种：

微波治疗：它的原理是利用微波的高频震动，使疣体内部水分蒸发，坏死脱落。微波治疗创面恢复较慢，容易继发感染。所以微波治疗适于治疗疣体较大的，孤立、散在的，同时要远离系带的，以防损伤包皮系带，影响男性的性功能。

激光治疗：对外阴、肛门周围等表浅的湿疣合适。它的特点是见效快，在治疗的当时，疣体即可脱落。常用的是二氧化碳激光，烧灼疣体，一般1次即可使疣体脱落。但是，由于激光的光束过于集中的原故，激光治疗只适用于疣体较小的尖锐湿疣，且激光治疗很容易复发。

药物疗法：针对尖锐湿疣的治疗，药物疗法主要有外用和口服两种。但因为药物会对患者的正常机体产生一定的副作用，并且尖锐湿疣的感染病毒隐藏在患者身体的深处，单纯的用药并不能直达病灶。一般的临床用药仅仅是局限于缓解病情症状的目的，并不能真正治愈。