前列腺炎，内科治疗：药物动力学研究以及临床经验证明，只有很少几种抗生素能在非急性前列腺炎症的状态下在前列腺分泌物中达到有效的治疗浓度。TMP能渗透到前列腺液中，并已证实能成功地治愈因敏感菌引起的慢性细菌性前列腺炎，长期治疗(12周)比短期疗法(2周)更有效。中断，则膀胱尿液将被重新感染，症状将重新出现。

前列腺炎，外科治疗：无论慢性前列腺炎是否能被内科治疗痊愈，均可进行外科治疗。由于前列腺炎合并结石仅用抗生素治疗难以治愈，因此慢性前列腺感染和前列腺结石常是手术的适应证。但不幸的是手术并发症(性功能障碍和尿失禁)限制了这一手术的选择。如果经尿道前列腺切除术能完全切除被感染的组织和结石，前列腺炎即获根治，但很难取得这种疗效，因为前列腺周围组织也有大量的感染病灶。