宫外孕流产的症状主要是阴道流血和腹痛。阴道流血发生在妊娠12周以内流产者，开始时绒毛与蜕膜分离。血窦开放，即开始出血。当胚胎完全分离排出后，因为子宫收缩，出血停止。

早期自然流产后的全过程均伴有阴道流血。晚期宫外孕流产时，胎盘已形成，流产过程与早产相似，胎盘继胎儿娩出后排出，一般出血不多，特点是往往先有腹痛，然后发现阴道流血。

晚期宫外孕流产后的症状则先有阵发性子宫收缩，然后胎盘剥离，故阴道流血出当下腹痛之后。流产时检测子宫大小、宫颈口是否扩张以及是否破膜，依据妊娠周数及流产过程不一样的而异。