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自然流产的发病原因特别复杂，涉及到遗传，免疫，感染、子宫、内分泌等，当中有来自父方的原因，有来自母方的原因，亦有来自胎儿自己的原因。
关于自然流产的危害事实上，一次自然流产对于下一次成功地足月顺产，并无不好的影响。可是发生两次自然流产，多多少少会给你的身体带来一定的伤害，该种情形下你需要去妇产科做一全面检查。自然流产因为状况特殊，因此常常会产生下列几类附带危害。
1、自然流产的危害——感染：各型流产都可以合并感染，发生于不全流产者比较多。感染可局限在子宫腔内，也可以蔓延到子宫周边，以至超出生殖器官而生成腹膜炎、败血症。
2、自然流产的危害——大失血：有时候不免流产或不全流产可导致严重大失血，以至休克。
3、自然流产的危害——胎盘息肉：可致成严重子宫出血，多于流产后几星期内发生。
4、自然流产的危害——急性肾功衰竭：流产后可因为急性大量失血及严重感染发生休克而引发急性肾功衰竭。
5、自然流产的危害——子宫复旧不好。