至今尚无定论,有自身免疫、感染、神经精神因素、细胞因子的作用、家族遗传等学说.药物因素、内分泌异常、慢性病灶等因素也可诱发本病.有人发现扁平苔藓患者的皮肤内葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G-6-PD)结构上可能有异常,亦有人有相反意见.另外皮疹中的呼吸酶与辅酶有活性改变,这些异常是否为扁平苔藓的病因,尚未确定.